（1）繩文人（英語：Jomon people、日語:じょうもんじん），舊石器時代後，約1萬6500年前的公元前145世紀到約3000年前的紀元前10世紀繩文時代的文化，大致分佈在現在的日本北海道，本州島，琉球群島。因此，在這個地區居住的印有繩文陶器的新石器時代人稱為繩文人。日本國立科學博物館等機構研究人員宣佈，他們成功解讀瞭日本古代繩文時期常染色體DNA的遺傳信息，並認為現代本州和族繼承瞭繩文文化居民10%DNA，繩文人祖先大約從3.8萬年至1.8萬年前從亞洲大陸來到日本，研究人員推斷，繩文人由亞洲大陸幾個不同形質人種組成混居過著狩獵采集生活。

（2）彌生人（日語：彌生人／やよいじん Yayoi-jin），是指彌生時代來到日本列島的移民團體，與繩文人在人類學上有明顯區別。又叫彌生時代的原始人，活動年代約在公元前1000年－公元3世紀中葉，因代表該時期文化特征的陶器，最初發現於日本東京都文京區彌生町，所以稱為彌生人。日本本土大和人大多是彌生人的後裔，但也有和繩文人的混合體。據估計，繩文人的祖先遺傳常染色體dna少於12%。另一項研究估計，東京人的繩文人祖先約占10%。大約在彌生時代的後半期，公元1世紀時，包括東海地方、北陸在內的西日本形成瞭廣大的地域勢力，在公元3世紀中期進入瞭古墳時代。2019年，日本國立科學博物館研究團隊最近的研究表明，日本人大多來自彌生人，彌生人基本上取代瞭當地的繩文人。

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（3）邪馬臺國（亦稱邪摩堆、夜麻登及耶麻騰）是《三國志》中《魏志·烏丸鮮卑東夷傳》倭人條（通稱魏志倭人傳）記載的倭女王國名。具體起始時間不詳，而且關於邪馬臺國的所在地，傳統上有畿內說與九州說，但因史料限制，尚無定論。

《魏志》記載，2世紀末日本有許多小國分立，邪馬臺國是統治這些小國的強大國傢。女王卑彌呼統率周圍的奴國和伊都國等許多小國，數次向魏國朝貢。女王死後，統治力量為之動搖，後立同族的臺與為王，力圖復興。當時的社會由王、大人、下戶、生口、奴婢等各種身份構成。王有主管祭祀的女王和負責政治、軍事的男王，共同進行統治，由大人協助。下戶受王和大人的支配。生口是戰俘（有人說是繩文人），相當於奴隸。

2010年，琉球大學名譽教授、海底遺跡研究會理事長木村政昭（日語：木村政昭）又提出琉球說（或稱沖繩說）。中國語言學傢鄭張尚芳認為邪馬臺是Yamato（日語大和）的音譯。大倭管市場，大夫管外交，大率是刺使（日後的太宰府）。

（4）奴國（Nakoku State），是日本彌生時代的小國，或位於今天的日本九州福岡縣，約存在於公元1世紀至公元3世紀，也是最早向我國入貢的部落小邦。根據《後漢書·東夷傳》所記載，公元57年，奴國國王向光武帝入貢。獲賜漢委奴國王印，國王受封倭奴國王。這印在江戶時代被挖掘出。另外，《魏志倭人傳》中也提到此國，有二萬戶人口。

（5）末盧國（Matsuro State），是一個日本北九州地區的古國，約存在於公元1世紀到公元6世紀初，地理位置在今日本佐賀縣的松浦半島南端。根據《魏志倭人傳》記載，末盧國有四千餘戶居民，依山靠海，草木茂盛。

（6）狗奴國（Gounu State）是《三國志》中《魏志烏丸鮮卑東夷傳》倭人條中所記載的倭人國傢之一。根據該條記載，2世紀末倭國大亂，分成許多小國，而邪馬臺國是當時最強大的國傢。狗奴國位於邪馬臺的屬國奴國之南，在卑彌呼奠定邪馬臺國之霸權後，狗奴國是唯一不附屬該國的國傢。狗奴國國王名叫卑彌弓呼，但掌握實權的官員名叫狗古智卑狗。卑彌弓呼與邪馬臺國女王卑彌呼素來不和，兩國互相攻擊。正始八年（247年），卑彌呼派遣載斯、烏越出使曹魏，向帶方郡太守王頎陳述兩國交戰的情況。但魏少帝曹芳決定不參與戰爭，僅派遣塞曹掾史張政攜詔書與黃幢（一種具有特殊榮譽的軍旗）前往詔諭其國。不久以後，卑彌呼逝世，但戰爭仍然持續。

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（7）大和國（英語：Yamato Kingdom，日語：やまとのくに ），又稱為大倭國、倭國、大養徳、大倭等，是日本古代的奴隸制國傢，存在於公元4世紀到公元7世紀，興起於日本本州中部奈良地區。大和國形成初期，以近畿大和地方為中心，君主被稱為大王。645年日本大化改新後，確立天皇統治制度，日本進入封建時代，大和時期結束。在考古學上，這段時期被稱為古墳時代。

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（8）平安時代（Heian Period），從794年桓武天皇將首都從長岡京移到平安京開始，到1192年源賴朝建立鐮倉幕府一攬大權為止。在奈良朝末期，朝廷與貴族勢力之間的矛盾激化。為瞭削弱權勢貴族和僧侶的力量，桓武天皇於784年決定從長岡遷都到山城國的平安京（今京都市），在那裡籌建新都，命名為平安京，希望借此獲得平安、吉利、安寧與和平。由於平安京在794年完工，故史傢常把794年作為平安朝的開始（也有許多國際上和日本國內的權威的歷史學傢把784年決定遷都的時間作為平安朝的正式開始時間）。平安時代的稱呼來自其國都的名字。

（9）蝦夷（Emishi），是古代日本的族群之一，根據其地理分佈分為南蝦夷、西蝦夷、渡島蝦夷、渡覺蝦夷等，主要分佈在日本東北部。蝦夷這個族群在文獻中首次提及的時間可以追溯到公元400年，在中國記錄中它們被稱為“毛茸茸的人”。明治元年（1868年），明治政府決定在蝦夷地區設置箱館裁判所，隨即把名稱改為箱館府；1869年，蝦夷地區改稱北海道。

（10）鐮倉幕府（1192年—1333年），是日本第一個幕府政權，建立者為源賴朝。鐮倉幕府的建立標志著日本中央貴族掌握實權的結束，而在貴族時代地位很低的武士登上瞭歷史舞臺。

建久三年（1192年）7月，源賴朝受封為征夷大將軍，正式開幕，史稱源氏幕府或鐮倉幕府。鐮倉幕府的建立也標志著天皇成為傀儡，幕府成為實際的政治中心。1318年，後醍醐天皇即位，決心恢復皇室權威，廢黜武傢院政，開始親政。正中元年（1324年），後醍醐天皇密謀倒幕，但計劃被幕府得知，第一次倒幕運動失敗，史稱“正中之變”。1331年，後醍醐天皇再次密謀倒幕，倒幕軍被幕府軍打敗，史稱“元弘之亂”，第二次倒幕運動失敗。

1333年，各地豪族都開始倒幕，幕府派足利高氏前去平亂，足利高氏早已不滿北條氏專制政權，途中倒戈天皇，號稱“勤王”，領兵反抗幕府，攻擊六波羅探題部隊。於此同時，新田義貞於關東起兵，攻下瞭鐮倉，北條高時及其一族相繼自殺，鐮倉幕府滅亡。

（11）室町幕府，也稱足利幕府，是日本歷史上第二個幕府政權，由足利尊氏於1338年開設，終於1573年，其間共經歷15代室町征夷大將軍（由於第10和12代將軍是同一人，所以有說是16代）。室町幕府雖然長達二百多年，但有一半時間國傢處於戰亂之中，幕府並無能力去控制擁兵自重的大名，日本步入長達一個半世紀的戰國時代。

室町幕府執政時期，由強大的守護大名任“管領”等要職輔佐將軍。室町幕府在行政方面由將軍總理一切政務。其下設“管領”，以輔佐將軍，一般由足利氏一族的斯波、細川、畠山三氏輪流擔任，謂之“三管領”。管領之下有侍所、問註所，政所等機構，而以侍所最為重要。在八代將軍足利義政任期內應仁之亂與細川政元的政變之後，日本各地大名豪族互相征伐兼並土地，不再聽從幕府號令，室町幕府勢力衰弱。應仁之亂開始日本進入瞭舉國混戰的戰國時代。雖然戰亂持續，但內外通商繁盛，農業、工業技術也有所提高。1573年（天正元年），第十五代將軍足利義昭被織田信長驅逐出京師，室町時代結束。

（12）江戶幕府（日語：江戸幕府／えどばくふ；1603年3月24日-1868年4月21日），又稱德川幕府（日語：徳川幕府／とくがわばくふ ），它是日本歷史上第三個、也是最後一個幕府政權，由德川氏開設於江戶（今東京）而得名。它從創始者德川傢康1603年受封征夷大將軍開始，直到1867年末任將軍德川慶喜還政予明治天皇為止，共經十五代征夷大將軍，歷時265年。

德川傢康建立幕府後，建立起幕府嚴密控制下的政治體制，經過德川秀忠、德川傢光兩代將軍，幕府統治趨於穩定。德川幕府對外實行鎖國政策，嚴禁日本人與外國貿易，禁止日本與海外交往，把外國商人和傳教士驅逐出境，隻許同中國、朝鮮、荷蘭等國通商，而且隻準在長崎一地進行。

18世紀上半期，資本主義的萌芽產生，新的生產方式的出現，從根本上動搖瞭幕府統治基礎。1868年德川幕府徹底垮臺。此後，日本基本結束瞭將軍及幕府統治的時代。