美軍目前共有11個聯合作戰司令部，其中6個按地理劃分、5個按功能劃分。

美國非洲司令部是全球六大戰區司令部之一，總部設於德國司徒加特的凱利軍營，負責美軍在非洲53個國傢（不含屬於美國中央司令部責任區的埃及）領土的作戰。目前歐洲、非洲兩司令部下的海軍部隊在體制上以第六艦隊的第60特遣隊作為指揮單位。除此之外，美軍在非洲亦設有非洲之角聯合特遣部隊。在指揮鏈上，非洲司令部司令官向美國國防部長匯報，部長再向上對美國總統匯報。

美國中央司令部是全球六大戰區司令部之一，創建於1983年，其前身為快速部署聯合任務部隊。“中央司令部”這個名稱，常常讓人誤以為其為美軍最高指揮機構，實際上該司令部為負責美軍在包括中東、北非和中亞的國傢行動的戰區級指揮機構。中央司令部作為美軍活躍的存在而參與瞭許多軍事行動，包括海灣戰爭、阿富汗戰爭和伊拉克戰爭。中央司令部的軍隊近期主要佈署於伊拉克和阿富汗一帶執行戰鬥任務，還在科威特、巴林、卡塔爾、阿拉伯聯合酋長國、阿曼、巴基斯坦等國設有基地，中亞國傢亦提供支援。先前，中央司令部軍隊也曾佈署於約旦和沙特阿拉伯，盡管後者國內並無駐紮實質的武裝部隊。

美國歐洲司令部 是全球六大戰區司令部之一，總部駐德國斯圖加特帕奇軍營。其防區包括瞭51個國傢和地區，區域面積超過5千4百萬平方公裡，包括瞭歐洲、俄羅斯、冰島、格林蘭和以色列。美國歐洲司令部司令官同時也兼任歐洲盟軍最高司令部司令官。

美國北方司令部 是美國全球六大戰區司令部之一， 主要任務是協助政府履行民事職責，抵禦針對美國本土、阿拉斯加、加拿大、墨西哥的襲擊。北方司令部是在九一一襲擊事件後，由小佈什總統授權組建。於2002年10月1日成立，為國防部的國防工作提供指揮和控制，協調民防部隊的防務支援。捍衛美國的傢園 - 保護我們的人民，國傢權力和行動自由。

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美國印太司令部，原稱美國太平洋司令部是美軍最早成立的聯合作戰司令部，全球六大戰區司令部之一，同時也是最大的一個，下屬兵力高達37.5萬人。其下屬的太平洋艦隊擁有13萬兵員以及包括5個航母戰鬥群在內的約200艘艦船和1100架飛機。占美國現役軍人總數的20%。司令部的管轄區域覆蓋超過50%的地球表面面積 - 約1.05億平方英裡（2.72億平方公裡），近60%的世界人口，橫跨36個國傢和16個時區。

美國南方司令部 是全球六大戰區司令部之一，責任區是加勒比海、中美洲和南美洲，也負責巴拿馬運河的防禦。南方司令部是由陸軍，海軍，空軍，海軍陸戰隊，海岸警衛隊和其他幾個聯邦機構中約1200多名軍人和文職人員組成的聯合司令部。這些軍種為南方司令部提供瞭對聯合特種作戰部隊，兩個聯合特遣部隊，一個跨部門聯合工作小組和安全合作組織等不同部分的指揮，來執行南方司令部任務和安全合作活動。南方司令部通過其組成部隊的指揮官，聯合任務組或機構間之工作隊和安全合作組織行使其作戰司令部的權力。

美國戰略司令部是美國國防部所屬11大一體化司令部（聯合作戰司令部）之一，負責空間作戰、信息作戰、導彈防禦、情報偵察監視、全球打擊、戰略威懾、大規模殺傷性武器等領域。戰略司令部組建於1992年，繼承原戰略空軍司令部，並在2002年合並瞭美國太空司令部，總部位於內佈拉斯加州奧弗特空軍基地。

將美國傳統核指揮和控制任務與空間任務，全球打擊，全球導彈防禦，全球指揮，控制，通信，計算機，情報，監視和偵察（C4ISR）相結合。這一動態命令使國傢領導層能夠獲得更多的瞭解世界各地特定威脅的統一資源和快速應對這些威脅的手段。全球運營中心的中樞是對國傢全球戰略力量實施指揮和控制的機構。美國運輸司令部是美國國防部下轄一體化作戰司令部之一，其職能是提供陸海空全領域的運輸支持，保障國傢將部隊和物資投送到任何需要的地方。運輸司令部的總部位於伊利諾伊州斯科特空軍基地，組建於1987年，現任司令是空軍上將達倫·麥克迪。

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空軍太空司令部 是美國空軍麾下一個一級司令部，總部位於美國科羅拉多州的彼得森空軍基地，該司令部成立於1982年9月，負責以人造衛星和洲際彈道導彈（ICBM）來保護美國本土，對美國掌握全球動向與武力投射非常重要，GPS也在該部管轄下，空軍成立美國戰略司令部一級司令部未果後，該司令部也並入本司令部。

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美國特種作戰司令部簡稱特戰司令部，是指揮美國陸軍、海軍、空軍和美國海軍陸戰隊所屬各特種部隊的聯合作戰司令部。該司令部是美國國防部的一部分，總部設在佛羅裡達坦帕麥克迪爾空軍基地。建立一個軍種聯合的特種作戰司令部的原因是由於1980年解救伊朗人質危機事件中鷹爪行動的的失利。之後，退休的海軍作戰部長海軍上將詹姆斯·霍洛韋主持調查，認為缺少指揮和控制以及特種部隊之間缺少相互的協調是本次任務失敗的主要因素。從1987年4月16日成立以來，美國特種作戰司令部參加瞭很多軍事行動，從1989年美國入侵巴拿馬到21世紀的伊拉克戰爭。

美國特種作戰司令部指揮一些秘密任務，如非常規戰爭、他國協防任務、特種偵察、心理作戰、民政事務、直接行動、反恐行動和毒品戰爭。美國特種作戰司令部在戰爭和非戰爭領域的全球表現，證明其為一個成熟、文化融合、裝備適當和具備適應性的特別行動部隊。每一個分支都有一個單獨的指揮司令部，獨立運作。當不同的特種部隊需要協同完成一項任務時，美國特種作戰司令部成為聯合指揮機構。

美國網絡司令部是美國軍方機構，負責開展網絡軍事行動及保護軍方電腦系統，屬於美國國防部的一體化作戰司令部。2009年6月23日，由美國國防部長羅伯特·蓋茨成立，2010年5月21日正式運行，國傢安全局局長凱斯·亞歷山大中將為首任司令 ，總部位於美國馬裡蘭州米德堡陸軍基地。2010年10月全面運作。