miRNA自从火起来,热度就一直没降过。本文通过多种在线数据库实例化草掘mPRNA和mRNA,讲解miRNA与mRNA如何相互预测
一
miRNA预测mRNA
1、 Targetscan数据库预测
以hsa-miR-486为例(hsa表示种属为人)
网址:http://www.targetscan.org/mamm_31/
点击获得结合位点详细信息
2、 miRDB数据库预测
以hsa-miR-486-5p为例
网址:http://www.mirdb.org/
3、RBPmap数据库预测
以hsa-miR-486-5p为例
网址:http://www.mirbase.org/
有多个数据库结果供选择,点击链接获得详细内容
二
mRNA预测miRNA
1、 Targetscan数据库预测
以人(human)smad 5为例
网址:http://www.targetscan.org/vert_72/
miRNA的信息,加权分数、结合率等等
2、http://microRNA.org数据库预测
网址:http://www.microrna.org/microrna/home.do
输入miRNA名字(可同时输入多个)
以smad 5为例,物种选择为所有
网址:http://www.microrna.org/microrna/home.do
mirSVR:热力学稳定性大小(要求小于等于-0.1)分值越低,表明miRNA-mRNA二者结合稳定性越强,相应miRNA下调基因的可能性越大
PhastCons:为基因非翻译区在各物种中进化保守性的强弱(大于等于0),保守性越大约好
分子生物学、细胞生物学、免疫学,论文基金申请写作,SCI润色。可私信沟通或V.X联系:potterlee。
dio,就是嚣张傲慢,又玩世不恭的感觉。 源自《JoJo的奇妙冒险》第三部星辰十字军中的反派角色之一的迪奥·布兰度(dio),迪 ...