1.ORF

ORF 的英文展開是 open reading frame（開放閱讀框）。

ORF 是理論上的氨基酸編碼區，可以通過分析一段基因序列得到的。把基因的mRNA輸入到分析程序中，分析程序會在核酸序列中尋找起始密碼子（ATG 或 AUG），然後按每 3 個核酸為一組，一直延伸尋找下去，直到碰到終止密碼子（TAA 或 TAG）。此時程序就把這個區域當成 一個ORF 區，認為理論上可以編碼一組氨基酸（註意：ORF不包含終止密碼子）。但問題是，在一個mRNA中尋找 ATG 並不靠譜。因為尋找到的 ATG 很可能是相鄰兩個密碼子的尾和頭的混合體。