百煉成鋼 | 同行哭瞭,邁維單一代謝組學文章突破100!

點此閱讀原文開學啦!要做的實驗,要看的文獻是不是該排上日程啦~近期,小編也對我們的合作客戶文章進行梳理,驚訝的發現,登記“在案”的單一組學-代謝組學客戶文章已經悄悄破100瞭,這勢必得分享給剛開學的你們,下半年的flag趕緊立起來,比如說讀10篇代謝組學的文獻。

為瞭方便大傢直接找到與自己研究相關的方向,我們也按照研究方向進行劃分,總共劃分為6大研究方向:

1.色澤篇目前研究中與顏色相關的物質主要有四種類型,其中花青素、類胡蘿卜素、甜菜色素是大傢較為熟知的物質類型,還有一類物質名為橙酮,與花青素同屬於類黃酮,但是其相關研究報道較少,因此關註度不如前三類物質:

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瞭解參與顏色形成的三大類物質之後,對於研究所關註顏色可能的相關物質我們就有瞭初步判斷。想要更加深入的設計實驗,還是得站在前人的肩膀上學習,效果勢必事半功倍,本篇共計帶來11篇利用代謝組學技術進行色澤的研究。

部分文章解讀鏈接如下:項目文章 | 代謝組學分析揭示不同顏色藜麥籽粒中類黃酮和酚酸的積累模式2.品質篇與色澤的研究不一樣的是,品質的研究范圍更加寬泛,從種子或果實的大小到果實的硬度,口味(酸甜苦辣),香氣等等,而這些品質也是實際生產中決定消費者喜愛程度的因素,這些品質也與代謝物息息相關。

因此對於不同的品質,可以根據自己的關註內容進行物質查詢,物種可以不僅僅限於本物種,可以擴展到其他物種中相關物質的研究,說不定可以在本物種中發現相似功能的物質。本篇共計38篇品質相關研究文章。

部分文章解讀鏈接如下:項目文章 | 新疆薔薇果的代謝活性成分及抗氧化活性分析(薔薇)項目文章 | 海南地區5篇高水平組學文章合集(黃皮)又雙叒叕2篇!華南農業大學發力代謝組學研究!(枇杷)項目文章 | 18個紅毛丹2篇!果實品質代謝組與味覺標志物分析(紅毛丹)項目文章4篇|代謝組在鐵皮石斛產量和品質研究中的應用(石斛)項目文章 | IF=6.3 !12個樣品代謝組數據揭示不同品種糜子抗氧化的差異(谷子)地道尋茶記 | 代謝組揭秘16種武夷巖茶香氣四溢的物質基礎(茶葉風味)項目文章 | 關於水果果實品質風味的多組學研究文獻合集(刺梨)3.生長發育篇植物的生長發育是一個復雜且長期的過程,這個過程中涉及到植物的營養生長和生殖生長兩個主要階段,在生長發育中,學者們一直都比較關註初生代謝物的變化,這主要是由於初生代謝物糖、氨基酸、脂質等參與瞭能量代謝,而有機酸參與瞭TCA循環的原因。近些年來,對於在生長發育過程中次生代謝物的變化也引起瞭學者們的關註,次生代謝物不僅僅是在植物的防禦過程中發揮作用,在植物的生長中發現可以作為植物生長調節劑,從而為生長防禦模式增加瞭另一層調控[1]。例如在擬南芥中,脂肪族3-羥丙基硫甙葡萄糖苷通過完整的雷帕黴素靶通路在生理濃度下抑制根系分生組織的生長[1],此外硫甙葡萄糖苷還可能調節生物鐘和開花時間[2]。除瞭這些,在生長發育過程中ROS的變化也逐漸進入大傢研究的視野,從非生物脅迫中我們知道,ROS的過多產生會導致細胞程序性死亡,而ROS又是有氧反應的產物,因此在生長發育過程中也不能存在過量的ROS,因此必然存在抗氧化的物質用於保持ROS的平衡[3]。

本篇一共16篇相關研究文章,涵蓋種子萌發、種子休眠、腋芽生長、花芽發育、花發育、果實成熟各個階段。

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部分文章解讀鏈接如下:項目文章2篇 | 相同樣本,不同組學手段在白菜細胞質雄性不育中的研究(白菜雄性不育)項目文章 | 脂肪酸輸出蛋白BnFAX6促進側芽生長的功能機制(油菜腋芽)4.非生物脅迫篇與動物或者人不一樣,植物在面臨復雜且多變的生存環境時無法通過移動去避免環境壓力帶來的影響,因此植物必需在短時間內感知並響應這些變化,使它們可以生存以及繁殖。在感應外界環境變化的方面,通常隻有植物的一小部分先於其他部分感知到環境條件的變化,這部分感知組織會產生系統信號,該信號傳播到其他組織部位,觸發這些組織部位的適應和防禦機制,這種“系統性”的變化會幫助植物更好的適應未來環境的變化。參與這種反應的感知組織被稱為“局部”組織,其餘的部位被稱為“系統”組織。研究表明,在許多類型的應激中,包括非生物條件,如光應激、機械應激和溫度應激,以及生物應激,如細菌、真菌和病毒感染,系統反應越快,植物就越有機會適應和防禦即將到來的非生物或生物挑戰[4]。抗壞血酸(AsA)、谷胱甘肽(GSH)、a-生育酚、氨基酸(如脯氨酸)、糖、類胡蘿卜素和奎寧酸衍生物(如綠原酸)被認為是在植物中起作用的抗氧化劑;然而目前還不清楚為什麼植物會產生如此多種多樣的抗氧化劑。隨著具有抗氧化活性的代謝物的積累,非生物脅迫也誘導產生各種特化代謝物,也有人認為根據皂苷、硫甙葡萄糖苷、酚酰胺、苯丙素和黃酮類化合物其在體外抗氧化活性,在體內也具有抗氧化作用[5]。

本篇一共18篇相關研究文章,包括研究最為關註的幹旱、高低溫、鹽堿脅迫、營養脅迫等類型。

部分文章解讀鏈接如下:客戶文章 | 廣泛靶向代謝組告訴你鹽脅迫下鹽地堿蓬的堅強(鹽地堿蓬鹽脅迫)項目文章 | 鄭果所焦中高老師團隊發表櫻桃采後UV輻射研究成果(櫻桃UV-C處理)項目文章 | 基於代謝組解析菊芋幼苗對幹旱脅迫的響應機制(菊芋幹旱)5.生物脅迫篇植物是微生物、線蟲、昆蟲和各種動物,甚至是其他植物的寶貴食物來源和庇護所。與一些細菌、真菌和線蟲的相互作用會破壞植物的生長和發育,導致疾病。與細菌和真菌的其他相互作用可以使植物受益,從而促進生長,並在具有挑戰性的環境條件下具有更好的恢復力。寄生植物會耗盡宿主的營養,導致生長發育不良。植物在這些相互作用中不是被動的參與者,它們產生大量的信號和生物活性分子,可以幫助確定給定相互作用的結果。這些化合物可以在局部起作用,也可以釋放到土壤中,運輸到遠端組織,以警告感染,甚至分泌到空氣中,以影響昆蟲的食性和行為,或向鄰近植物發出信號[5]。對植物-生物相互作用機制的深入理解揭示瞭葉綠體是介導這些相互作用的眾多分子和信號的來源。其中一些是葉綠體的直接產物,如糖、氨基酸和根系分泌物中的抗菌素,而另一些則是葉綠體代謝的副產物,如通過調節核基因表達來調節防禦反應的逆行信號。我們會發現,與非生物脅迫一致的是,生物脅迫一起的系統信號也包括激素、ROS等反應,不同的是,除瞭植物本身積累代謝物用於抵抗生物脅迫以外,植物還會釋放出物質到空氣中,用於警示臨近的植物或者保衛自身。因此在進行生物脅迫的研究中,利用代謝組進行檢測時我們則可以考慮同時檢測非揮發性和揮發性的物質。

本篇共計帶來4篇利用單一組學技術代謝組學的相關研究文獻,主要覆蓋兩大生物脅迫領域抗蟲和抗病。

7.食品加工保鮮篇食品在加工、運輸和保藏過程中,常常由於受到氧氣、微生物、溫度、濕度、光線等因素的影響,而使食品的色、香、味及營養發生變化,甚至導致食品敗壞,降低食品的食用價值。因此,如何盡可能地保存食品原有的優良品質特性是食品加工,運輸和保存過程中的一個重要問題。而在食品這些不同的變化中,其本質影響的是其中成分的變化,例如儲存時間過長,味道發生改變,主要是由於香味物質的減少,而異味物質的增多,因此不管是保鮮還是加工都能充分利用代謝組學技術解析其變化的原因。本篇共計帶來23篇加工保鮮研究,物種覆蓋我們日常常見的水果、飲品、糧食作物等。

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部分文章解讀鏈接如下:真香!6個樣本測廣靶見刊FC(蜂蜜發酵)項目文章|農產品加工代謝組-板栗鈣化研究(板栗保鮮)項目文章 | 代謝組學揭示花生在烘烤過程中代謝物的動態變化(花生加工)項目文章 | 王炸!邁維代謝助力合作單位連發三篇高水平茶葉研究文章!(黑茶發酵/綠茶加工/普洱茶加工)項目文章 | Food Chem兩篇!杏子和荸薺代謝組研究(荸薺加熱)項目文章 | 廣靶助力白牡丹茶不同藏期品質研究(白茶儲藏)項目文章 | 脂質組學助力油脂加工研究(榛子加工)項目文章 | 脂質組解析低溫緩解菠蘿果實內部褐變的機制(菠蘿儲存)文末福利百篇文獻免費下載!

獲取方式長按識別後臺回復關鍵詞即可下載後臺回復“色澤篇”、“品質篇”、“生長發育篇”、“非生物脅迫篇”、“生物脅迫篇”、“食品加工保鮮篇”即可獲取鏈接,下載所有相關文獻!參考文獻:1.Erb M, Kliebenstein DJ. Plant Secondary Metabolites as Defenses, Regulators, and Primary Metabolites: The Blurred Functional Trichotomy. Plant Physiol. 2020 Sep;184(1):39-52.2.Malinovsky FG, Thomsen MF, Nintemann SJ, Jagd LM, Bourgine B, Burow M, Kliebenstein DJ. An evolutionarily young defense metabolite influences the root growth of plants via the ancient TOR signaling pathway. Elife. 2017 Dec 12;6:e29353.3.Tsukagoshi H. Control of root growth and development by reactive oxygen species. Curr Opin Plant Biol. 2016 Feb;29:57-63. 4.Fichman Y, Mittler R. Rapid systemic signaling during abiotic and biotic stresses: is the ROS wave master of all trades? Plant J. 2020 Jun;102(5):887-896.5.Nakabayashi R, Saito K. Integrated metabolomics for abiotic stress responses in plants. Curr Opin Plant Biol. 2015 Apr;24:10-6.精彩合集,歡迎收藏

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