#基因時間# ROS1融合及恩曲替尼在膠質瘤中的應用研究報道

泛生子“基因時間”欄目旨在為腫瘤診療領域醫生提供更便捷的學術平臺,傳遞領域前沿進展、探討臨床應用實踐,與全國專傢攜手推動腫瘤領域精準醫學發展。

本期“基因時間”學術快訊邀請到瞭復旦大學附屬華山醫院神經外科姚成軍教授分享近期發表在《Acta Neuropathologica》上關於ROS1融合在多種膠質瘤的融合伴侶,可作為潛在的治療靶點及《Neuro Oncology》上使用恩曲替尼治療2例嬰兒型半球膠質瘤的案例報道,詳情如下:

本文編譯經由姚成軍教授審核

研究背景:

膠質瘤是中樞神經系統(CNS)最常見的原發性腫瘤。在低級別膠質瘤中,絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路頻繁改變,可能提供治療靶點。目前,MAPK通路以外、基於作用機制的治療方法很少。然而,特別是次全切除、復發或高度惡性腫瘤患者,可能從檢測出其他的特異性致癌驅動因子中獲益,這些驅動因子不僅提供瞭對疾病發病機制的瞭解,還提供瞭個性化癌癥治療的靶標。ROS1基因編碼的受體酪氨酸激酶參與多種癌癥的染色體重排,由於其特異性抑制劑已被批準用於多個實體腫瘤,使其成為瞭一個有吸引力的治療靶點。在膠質瘤中,ROS1融合的數據僅限於單個病例或小隊列中。最近,在一個主要人群為嬰兒的膠質瘤患者列隊中發現瞭這些融合的富集(約7%)。

然而,在膠質瘤中常規的ROS1診斷評估僅限於少數專業中心或分子信息試驗中應用。因此,到目前為止,尚未對ROS1融合在所有年齡組廣泛的神經膠質腫瘤系列中的情況進行全面研究。在各種類型的低至高級別膠質瘤中的分佈尚不清楚。同樣,尚無數據確定ROS1融合陽性膠質瘤是否具有進一步的生物學特征,可能支持膠質瘤的“ROS1亞型“。在此,作者在包含膠質瘤譜系內不同診斷的20723例患者的大型隊列中研究瞭ROS1融合,以闡明這種融合的頻率和各自病例的特征。

研究結果:

為瞭確定具有影響染色體6q(ROS1基因座周圍)的結構改變的膠質瘤,作者系統地評估瞭包含20723個膠質瘤的DNA甲基化數據集的拷貝數數據,而不考慮特定的分類和WHO分級。由於高比例的ROS1融合(尤其是最常見的GOPC:ROS1融合)伴隨拷貝數譜中染色體6q22的片段缺失,因此篩選瞭覆蓋該區域的DNA甲基化數據的片段缺失。

自動分析後進行檢查,並識別出14例潛在病例。在可疑病例上,作者進行瞭RNA和靶向外顯子測序,並證實14例腫瘤均存在ROS1融合,最常見的GOPC:ROS1融合11例。ROS1與ZCCHC8、ARCN1或CHCHD3融合各1例(圖1)。

337fac504e423880a07033152be2ee63圖1:ROS1融合與患者樣本信息

在所有融合中,ROS1的激酶結構域均被保留。所有ROS1融合膠質瘤中ROS1轉錄水平上調。有趣的是,ROS1伴侶與不同的細胞功能相關,例如細胞內蛋白質運輸和RNA加工和降解。此外,在進行初始篩選後,通過在診斷背景下進行RNA測序已經檢測到的另外兩個ROS1融合的膠質瘤樣本被納入後續分析。其中一個樣本具有GOPC:ROS1融合,顯示染色體6q22的片段性缺失,而另一個病例具有CEP85L:ROS1融合,染色體6q22的片段性獲得(圖2)。

85dc6ff68ab03d6ae72c246a89967133圖2:ROS1融合類型

研究數據顯示在DNA甲基化分類的嬰兒型半球膠質瘤中ROS1基因融合的頻率很高,這與最近的研究一致。這組臨床上不同的膠質瘤(最初常被診斷為膠質母細胞瘤)攜帶ROS1、ALK、NTRK1/2/3或MET作為融合伴侶的基因融合,發生率較高。然而,作者發現ROS1融合也發生在毛細胞型星形細胞瘤或IDH野生型膠質母細胞瘤患者中,強調瞭ROS1融合不是嬰兒型半球膠質瘤的特異性改變,也不局限於兒童膠質瘤患者。

c581a74f4c38974b6004a109ee5caefb圖3:膠質瘤ROS1融合分佈甲基化tSNE散點圖

案例報道:

第1例患者為一名1個月大的女性患兒,腫瘤在常規神經超聲檢查中被診斷為顱內腫塊。MRI提示:左額頂部實性1.5 × 1.6 × 1.7 cm腫塊,邊界清楚,增強均勻。最初的選擇是觀察等待方案,但在2個月內,患兒腫瘤大小達到2.6 × 2.4 × 2.9 cm。進行瞭全切除,組織病理學檢查符合高級別膠質瘤,具有上皮樣和橫紋肌樣特征。RNA測序顯示ZCCHC8:ROS1,綜合診斷為嬰兒型大腦半球膠質瘤,ROS1重排。患者根據BabyPOG方案接受化療。化療3個周期後,MRI提示局部復發。然後患兒接受瞭近全切除,組織病理學檢查顯示瞭相似的形態學特征。考慮使用兩種ROS1激酶抑制劑:克唑替尼和恩曲替尼。由於恩曲替尼穿透血腦屏障的能力被優先考慮。恩曲替尼300 mg/天的劑量給藥。迄今為止,患兒接受恩曲替尼治療11個月後臨床保持穩定,MRI顯示無復發體征,無治療相關不良事件。

第2例為新生女嬰,表現為頭圍增大,左側輕偏癱。MRI提示:右半球巨大不均勻富血供腫塊,12.5 × 10 × 9.6 cm,內見囊性成分,瘤內出血跡象。由於存在危及生命的出血風險,決定不進行活檢。根據HIT-MED指南方案進行化療。化療2個周期後的MRI顯示疾病進展,與神經功能惡化。經活檢發現神經膠質腫瘤,罕見星形母細胞性假菊型團。檢測出ZCCHC8:ROS1融合,與第一例所述相同。恩曲替尼90 mg/天作為挽救治療給藥。患兒經靶向治療3周後進行的MRI顯示快速顯著緩解,腫瘤的實體成分消退,無明顯副作用。患兒繼續接受恩曲替尼治療5個月,臨床穩定,無神經功能損傷。

圖4患兒治療前後影像學變化

討論:

盡管在其他膠質瘤中相對罕見,但從治療角度來看,因為有特異性抑制劑可以使用使得ROS1融合基因的鑒定很重要。通過拷貝數譜分析進行篩選,隨後使用RNA測序進行驗證,為識別可能從這種靶向治療中獲益的患者提供瞭一種有效的方法。然而,如在診斷環境中通過RNA測序鑒定的一個病例所示,並非所有ROS1融合變體都必然顯示ROS1位點周圍缺失。例如,拷貝中性易位也可能導致ROS1融合,通過篩查節段性6q22缺失將遺漏此類病例。因此,RNA測序仍然是充分檢測這些罕見融合的“金標準”。然而,需要註意的是,特定ROS1抑制劑的腫瘤異質性和血腦屏障通透性可能是限制靶向治療療效的主要問題之一。

ROS1重排在多種兒童惡性腫瘤中被描述,包括兒童型高級別膠質瘤、膠質神經元腫瘤、非典型腦膜瘤、炎性肌纖維母細胞瘤和胸膜肺母細胞瘤。在STARTRK-NG試驗中評價瞭針對ROS1融合蛋白的靶向治療的療效。然而,僅2例攜帶GOPC:ROS1和EEF1G:ROS1融合的膠質瘤患者入組試驗;均顯示部分腫瘤緩解。此外,2例ROS1靶向治療的單個病例,ARCN1和ZCCHC8:ROS1融合膠質瘤分別顯示治療4個月和11個月後對恩曲替尼耐藥。耐藥機制可能涉及ROS1激酶結構域(F2004 C/I和G2032R)的繼發性點突變或其他信號通路激活。理論上可以通過幾種方式:放療、不同的激酶抑制劑或新一代ROS1抑制劑的組合來克服耐藥性,仍還需要進一步的臨床試驗。

總結

嬰兒型半球膠質瘤(iHGGs)作為兒童型高級別膠質瘤的一個生物學和臨床不同的亞型,它明確標志是與受體酪氨酸激酶ALK、ROS1、NTRK1/2/3或MET發生重排。ROS1融合陽性的嬰兒型半球膠質瘤是一種罕見的腫瘤亞型,預後相對較差,此類腫瘤最典型的ROS1融合伴侶是GOPC。在此,報道瞭2例ROS1:ZCCHC8融合的iHGG病例。患者在臨床表現、MRI特征和組織病理學方面存在重大差異,但2例患兒均成功接受NTRK/ROS1/ALK抑制劑恩曲替尼治療。上述病例也強調分子檢測對膠質瘤患者優化治療的重要性。

盡管研究強調瞭ROS1融合是一個相對罕見,但可作為潛在的、與治療高度相關的藥物靶點,用於不同組織學分級和生物學類別的膠質瘤亞型。由於ROS1融合不僅在嬰兒型半球膠質瘤中出現,此研究表明需要擴大嬰兒膠質瘤以外的這種改變的檢測。

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